عشق "یوجین کسپرسکی"به ریاضیات , آینده وی را رقم زد. یکی از سرگرمی های او در دوران دبیرستان حل مسئله های منتشر شده در مجلات ریاضی بود. اودر طول سال های پایانی خود در دبیرستان ، در کلاس های فوق برنامه خصوصی  که در زمینه فیزیک و ریاضیات توسط موسسه فیزیک و صنعت مسکو , سازماندهی شده بود, حضور داشت. یوجین دو سال آخر دبیرستان خود را در رشته های فیزیک و ریاضیات که برای دانش آموزان با استعداد توسط دانشگاه دولتی مسکو برگزار شده بود,سپری کرد.

در سال 1987 ، از موسسه رمزنگاری ، مخابرات و علوم کامپیوتر ، ودر رشته مهندسی ریاضی    فارغ التحصیل شد.
پس از فارغ التحصیلی ، یوجین مشغول به کار در یک موسسه تحقیقاتی شد. آنجا بود که یوجین برای اولین باردر ماه اکتبر سال 1989 پس از تشخیص ویروس Cascade بر روی کامپیوتر خودشروع به مطالعه روی ویروس های کامپیوتری نمود

یوجین ویروس را تجزیه و تحلیل نموده ویک ابزار برای از بین بردن آن تهیه نمود-- این اولین باری بودکه او چنین ابزاری را تولید وعرضه نمود. سپس او شروع به جمع آوری برنامه های مخرب و ماژول هایی برای ازبین بردن آنها نمود. این مجموعه عجیب و غریب بعدها پایگاه داده آنتی ویروس معروف کسپرسکی را تشکیل داد. امروز ، این بانک اطلاعاتی شامل بیش از 4 میلیون رکورد است و یکی از پایگاه های داده یکی از کامل ترین آنتی ویروس ها در جهان است.
در سال 1991 ، یوجین به مرکز فن آوری اطلاعات KAMI  پیوست ، جایی که او و گروهی از همکاران حرفه ای اش  دست به توسعه پروژه آنتی ویروسAVP نمودند. به رسمیت شناختن بین المللی پروژه در سال 1994 رخ داد ، زمانی که AVP ناشناخته ,عملا برنده مسابقه توسط آزمون آزمایشگاه دانشگاه هامبورگ با نشان دادن سرعت کشف و شناسایی ویروس بالاتر از برنامه های محبوب آنتی ویروس در آن زمان شد.